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基于CRISPR/Cas9技術(shù)的煙草NtDXR基因敲除及功能研究獲進(jìn)展(圖)

2016年07月06日 來(lái)源:云南煙葉信息網(wǎng) 作者:
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  煙草在線據(jù)云南煙葉信息網(wǎng)報(bào)道  近日發(fā)表在《煙草科技》2016年第6期上的“基于CRISPR/Cas9技術(shù)的煙草NtDXR基因敲除及功能分析”研究揭示,NtDXR基因在煙草葉綠素等色素合成中起重要作用,NtDXR基因敲除后發(fā)現(xiàn)有堿基插入、缺失與置換,部分T0代轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性植株呈現(xiàn)白化表型,推測(cè)NtDXR基因突變能阻斷煙草質(zhì)體色素合成。

  5-磷酸脫氧木酮糖還原異構(gòu)酶(DXR)是2-甲基赤蘚糖醇-4-磷酸(MEP)生物合成途徑中的第一個(gè)限速酶,能催化5- 磷酸脫氧木酮糖(DXP)生成MEP。由MEP途徑合成的西柏烷類(lèi)化合物、類(lèi)胡蘿卜素類(lèi)化合物和巖薔薇類(lèi)化合物是煙葉重要的致香前體物質(zhì),DXR基因表達(dá)的強(qiáng)弱會(huì)影響煙葉中單萜、雙萜以及四萜類(lèi)物質(zhì)的重新分配,影響煙葉品質(zhì)。

  該研究從普通煙草品種紅花大金元中克隆獲得NtDXR基因,采用熒光定量PCR技術(shù)分析NtDXR在紅花大金元不同發(fā)育時(shí)期、不同組織中的表達(dá)模式,同時(shí)利用CRISPR/Cas9技術(shù)構(gòu)建了NtDXR敲除載體,獲得了DXR基因突變的植株。結(jié)果表明,NtDXR基因在花中高表達(dá),在雌蕊和葉中次之;利用CRISPR/Cas9系統(tǒng)定點(diǎn)敲除NtDXR基因后,檢測(cè)目的基因靶位點(diǎn)序列發(fā)現(xiàn)有堿基插入、缺失與置換,并且部分T0代轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性植株呈現(xiàn)白化表型,暗示NtDXR基因在煙草葉綠素等色素合成過(guò)程中起重要作用,推測(cè)NtDXR基因的突變能阻斷煙草質(zhì)體色素的合成。

  CRISPR/Cas9系統(tǒng)是近年發(fā)展迅速的一種基因組編輯技術(shù),該技術(shù)利用向?qū)NA(guide RNA)與基因的靶序列結(jié)合,在Cas9核酸內(nèi)切酶的作用下對(duì)靶DNA進(jìn)行切割,基因組斷裂后啟動(dòng)DNA修復(fù)系統(tǒng),修復(fù)過(guò)程中可能有堿基的插入、缺失和置換,從而引起蛋白翻譯發(fā)生錯(cuò)誤,導(dǎo)致基因功能喪失。該研究明確了NtDXR基因在煙草萜類(lèi)化合物代謝中的作用,為選育煙草優(yōu)良品種提供理論基礎(chǔ)。

左圖為轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性組培苗,右圖為呈白化表型的轉(zhuǎn)基因植株

圖1 轉(zhuǎn)基因植株T0代表型

M. Trans2K DNA Marker 1-6. pORE-Cas9/gRNA-NtD transgenic plants

  XR載體菌液PCR產(chǎn)物。a.敲除載體PCR電泳圖 b.敲除載體測(cè)序結(jié)果分析(紅色堿基為靶位點(diǎn)序列) c.敲除載體示意圖

圖2 敲除載體檢測(cè)及結(jié)構(gòu)示意圖

圖3 轉(zhuǎn)基因煙株內(nèi)源NtDXR 基因序列分析(藍(lán)色堿基為靶位點(diǎn),紅色堿基為突變位點(diǎn))

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