雪茄煙發酵目的是為了得到更好的口感味道，去除刺激氣味、焦油、尼古丁、雪茄煙氣的粗糙感、辣、苦澀等不良感覺，使煙葉經過微生物作用、生物酶催化、反映在其發生的化學變化上。

　　雪茄的發酵最長可以經歷三個階段的老化發酵。第一次是在葉子收獲以后，在雪茄工廠庫房里，收獲來的煙葉被堆捆成煙葉垛，覆蓋上布進行發酵，雪茄工人嚴密監控溫度隨時調整，這樣的日子在古巴的雪茄工廠里要經歷1-3個月。直到葉子變色，變成更深的黃色。其后分揀、并按雪茄葉子的不同等級再淋水再發酵可大量去除焦油、尼古丁等。

　　當雪茄開始卷制，粘合劑以及濕潤的茄衣、夾套會帶給雪茄一些過量的水分，這時雪茄工廠會將卷制好的雪茄煙再次進行一個短期的發酵，大約30天，這樣雪茄的味道會更加均勻，各個部分達到很好的融合，同時提高干燥程度，一支支雪茄煙平和下來進入可享用的狀態。一些不具備繼續醇化潛力的雪茄煙就可以被點燃了。而那些潛質良好的雪茄煙還會經歷第三次的發酵。

　　這次的發酵屬于第三次，古巴雪茄必不可少的階段，通常這個階段3年以上，但不乏7、8年甚至10年發酵的雪茄煙(不通品牌的不通款醇化都不同)。雪茄潛在的豐富味道被完全喚醒，醇化雪茄“養雪茄”的樂趣正在于此，充滿神秘誘惑又有著不確定性，這是雪茄發酵的第三個階段，在此說明一下并非所有雪茄都需要此階段的發酵，這個階段只限于口味比較濃重的優質雪茄。